生物医疗相关的分类和本体包括被广泛应用的疾病分类系统ICD9和ICD10、医学主题词表MeSH、临床医疗术语集SNOMED-CT，还还包括面向药物的命名系统RxNorm、针对观测指标的编码系统LOINC、基因本体Gene Ontology等。其中，ICD9、ICD10和LOINC有对应的中文版本，MeSH嵌入在PubMed中提供汉化版本。
一体化医学语言系统UMLS整合了生物医学领域，包括ICD-10、MeSH、SNOMEDCT、LOINC、RxNorm、Gene Ontology在内的100多部受控词表，共收录了300多万个生物医学概念和1200多万个概念名词。此外，UMLS还提供了词表之间的映射结构，使这些不同术语系统能够彼此转换。
